そういや自分は大体コンビ萌えが多い（ＣＰじゃないよ）と思ったんでちょっと共通点が無いか考えてみる。
（って随分前にもやったような、そうでないような）

・キョウスケ＆アクセル（スパロボＯＧ）
　立ち位置：元々は敵同士。後に味方（いいライバル関係）
　性格：どっちもクール2枚目だけど熱血タイプ。

・上杉景勝＆直江兼続（史実、無双他）
　立ち位置：トップと参謀だけど幼馴染。
　性格：殿…寡黙、そして侍。　
　　　　かね…曲がったことは大嫌い。冷静かどうかは分からないが頭は切れる

・シグナル＆コード（ツインシグナル）
　立ち位置：師匠と弟子。
　性格：シグナル…熱血馬鹿の主人公　コード…気難しく頑固、俺様

・孫策＆周都督（三国志、無双他）
　立ち位置：トップと参謀だけど幼馴染。
　性格：孫策…明朗快活、無双だと熱血馬鹿タイプ　周都督…冷静で頭が切れる

・フリック＆ビクトール（幻想水滸伝）
　立ち位置：腐れ縁
　性格：フリック…二枚目、参謀タイプ？　ビクトール…がさつ？

・シンタロー＆キンタロー（ＰＡＰＵＷＡ）
　立ち位置：大元は同一人物、元敵、後にトップと補佐
　性格：シンタロー…俺様　キンタロー…天然だけどお気遣いの紳士

うーん、キョウ＆アク以外は殆どリーダータイプあるいは主人公タイプと補佐（大体頭が切れる人）だなー。どっちか好きかというと、なかなか難しい…。
キョウ＆アクはそれこそ踏み台議論が出そうで嫌だｗ某スレで言ってたけど、キョウスケは戦術が強くてアクセルは戦略が強いイメージだけどねー…。